【技术文档摘要】：

MCP RDKit 项目

概述

mcp_rdkit 项目集成了 RDKit 库与 MCP（模型上下文协议）框架，提供高级化学信息学工具。它包括分子可视化、描述符计算以及与 MCP 服务器交互的功能。

特性

• 分子可视化：使用 RDKit 生成分子图像。
• 描述符计算：计算分子描述符，如分子量、logP 等。
• MCP 服务器集成：与 MCP 服务器通信以执行高级化学信息学任务。

项目结构

• mcp_rdkit/

  • __main__.py：应用程序的入口点。初始化 MCP 服务器并以“标准输入输出”模式运行。
  • rdkit_helper.py：包含用于 RDKit 操作的帮助函数，包括：
    • 将 PIL 图像转换为 base64。
    • 与 MCP 服务器接口。
    • 使用 RDKit 进行化学计算。

• setup.py：打包和分发的配置。

要求

• Python 3.8 或更高版本
• RDKit 库
• MCP 框架

安装

1. 使用 pip 安装包：

   pip install mcp-rdkit
   

2. 运行应用程序：

   python -m mcp_rdkit
   

示例

您可以直接将其集成到 Claude App 中：

使用方法

• 启动 MCP 服务器： 应用程序启动一个可以处理化学信息学任务的 MCP 服务器。

• 生成分子图像： 使用 RDKit 帮助函数来可视化分子。

• 计算描述符： 利用 RDKit 的描述符计算工具进行化学分析。

MCP 配置示例

要使用 RDKit 服务器与 MCP，将以下配置添加到您的 mcp 配置文件中：

"rdkit-server": {
  "type": "stdio",
  "command": "python",
  "args": [
    "-m",
    "mcp_rdkit"
  ]
}

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